Homo sapiens Protein: POLR2E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-13795.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | POLR2E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide E, 25kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | hRPB25; hsRPB5; RPABC1; RPB5; XAP4; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000215587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-13793 (POLR2E) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Common component of RNA polymerases I, II and III which synthesize ribosomal RNA precursors, mRNA precursors and many functional non-coding RNAs, and small RNAs, such as 5S rRNA and tRNAs, respectively. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. Pols are composed of mobile elements that move relative to each other. In Pol II, POLR2E/RPB5 is part of the lower jaw surrounding the central large cleft and thought to grab the incoming DNA template. Seems to be the major component in this process (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:9852112}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 109 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000783
RNA polymerase, subunit H/Rpb5 C-terminal IPR005571 RNA polymerase, Rpb5, N-terminal IPR014381 DNA-directed RNA polymerase RPB5 subunit, eukaryote/virus |
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PFAM |
PF01191
PF03871 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF000747
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SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P19388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P19388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.737181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 180664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 15946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC004151 AK312625 BC004441 BC034144 CH471139 D38251 J04965 S42643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA62401 AAB19339 AAC03238 AAH04441 AAH34144 BAA07406 BAG35511 EAW69548 EAW69549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||