Homo sapiens Protein: PRDM9 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-13914.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRDM9 | ||||||||||||||||||||
Protein Name | PR domain containing 9 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000296682 | ||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-13910 (PRDM9) | ||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||
Function | Histone methyltransferase that specifically trimethylates 'Lys-4' of histone H3 during meiotic prophase and is essential for proper meiotic progression. Does not have the ability to mono- and dimethylate 'Lys-4' of histone H3. H3 'Lys-4' methylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional activation. Plays a central role in the transcriptional activation of genes during early meiotic prophase (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Chromosome {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001214
SET domain IPR001909 Krueppel-associated box IPR003655 Krueppel-associated box-related IPR007087 Zinc finger, C2H2 IPR015880 Zinc finger, C2H2-like IPR019041 SSXRD motif |
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PFAM |
PF00856
PF01352 PF00096 PF09514 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||
SMART |
SM00317
SM00349 SM00355 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9NQV7 | ||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9NQV7 | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RD68 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56979 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.283096 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_064612 | ||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:13994 | ||||||||||||||||||||
OMIM | 609760 | ||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43307 | ||||||||||||||||||||
HPRD | 17905 | ||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AC025451 AF275816 AK301776 DQ388610 FJ899866 FJ899873 FJ899885 FJ899887 FJ899899 GU216223 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAF87242 ABD47939 ADA68126 ADA68133 ADA68145 ADA68147 ADA68159 ADA71146 BAG63234 | ||||||||||||||||||||