Mus musculus Protein: Trim28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-143985.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trim28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tripartite motif-containing 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA408787; KAP-1; KRIP-1; MommeD9; Tif1b; Tif1beta; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000005705 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-143983 (Trim28) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Nuclear corepressor for KRAB domain-containing zinc finger proteins (KRAB-ZFPs). Mediates gene silencing by recruiting CHD3, a subunit of the nucleosome remodeling and deacetylation (NuRD) complex, and SETDB1 (which specifically methylates histone H3 at 'Lys-9' (H3K9me)) to the promoter regions of KRAB target genes. Enhances transcriptional repression by coordinating the increase in H3K9me, the decrease in histone H3 'Lys-9 and 'Lys-14' acetylation (H3K9ac and H3K14ac, respectively) and the disposition of HP1 proteins to silence gene expression. Recruitment of SETDB1 induces heterochromatinization. May play a role as a coactivator for CEBPB and NR3C1 in the transcriptional activation of ORM1. Also corepressor for ERBB4. Inhibits E2F1 activity by stimulating E2F1-HDAC1 complex formation and inhibiting E2F1 acetylation. May serve as a partial backup to prevent E2F1-mediated apoptosis in the absence of RB1. Important regulator of CDKN1A/p21(CIP1). Has E3 SUMO-protein ligase activity toward itself via its PHD-type zinc finger. Specifically sumoylates IRF7, thereby inhibiting its transactivation activity. Ubiquitinates p53/TP53 leading to its proteosomal degradation; the function is enhanced by MAGEC2 and MAGEA2, and possibly MAGEA3 and MAGEA6. Mediates the nuclear localization of KOX1, ZNF268 and ZNF300 transcription factors (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:10330177, ECO:0000269PubMed:11154279, ECO:0000269PubMed:12154074}. Note=Associated with centromeric heterochromatin during cell differentiation through CBX1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 85 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 139 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:109274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000104
Antifreeze protein, type I IPR000315 Zinc finger, B-box IPR001487 Bromodomain IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR001965 Zinc finger, PHD-type IPR003649 B-box, C-terminal IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR019787 Zinc finger, PHD-finger |
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PFAM |
PF00643
PF00439 PF13639 PF14634 PF00628 |
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PRINTS |
PR00308
PR00503 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00297 SM00184 SM00249 SM00502 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q62318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q62318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5EBP9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.489366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Trim28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF230391 AF230392 AF230878 AK089084 AK141357 BC058391 BC089337 U67303 X99644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB17272 AAG02638 AAG50170 AAG50171 AAH58391 AAH89337 BAC40742 BAE24661 CAA67963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||