Mus musculus Protein: Ldb3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-149842.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ldb3 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | LIM domain binding 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AW742271; PDLIM6; ZASP; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000022330 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-149830 (Ldb3) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May function as an adapter in striated muscle to couple protein kinase C-mediated signaling via its LIM domains to the cytoskeleton. {ECO:0000303PubMed:10391924}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, perinuclear region {ECO:0000269PubMed:10391924}. Cell projection, pseudopodium {ECO:0000269PubMed:10391924}. Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000269PubMed:10391924}. Cytoplasm, myofibril, sarcomere, Z line {ECO:0000269PubMed:10391924}. Note=Localized to the cytoplasm around nuclei and pseudopodia of undifferentiated cells and detected throughout the myotubes of differentiated cells. Colocalizes with ACTN2 at the Z-lines. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed primarily in adult heart and skeletal muscle, and detected at lower levels in lung. Isoforms are expressed in a tissue-specific manner. Isoform 1, isoform 3 and isoform 5 are expressed in heart, whereas isoform 2, isoform 4 and isoform 6 are expressed in skeletal muscle. {ECO:0000269PubMed:10391924, ECO:0000269PubMed:10427098, ECO:0000269PubMed:10727866, ECO:0000269PubMed:12499364}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1344412 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001478
PDZ domain IPR006643 ZASP |
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PFAM |
PF00595
PF13180 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00228
SM00735 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9JKS4 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9JKS4 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 24131 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29733 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001034165 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 1WJL | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ldb3 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26942 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF114378 AF114379 AF228057 AF228058 AJ005621 AK004020 AK137181 AK142292 AK172980 AY206011 AY206012 AY206013 AY206015 BC099596 BC138793 BC145420 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD42950 AAD42951 AAF33847 AAF33848 AAH99596 AAI38794 AAI45421 AAO26187 AAO26188 AAO26189 AAO26190 BAB23128 BAD32258 BAE23262 BAE25016 CAB46747 | ||||||||||||||||||||||