Mus musculus Protein: Arcn1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-158212.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Arcn1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | archain 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000034607 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-158210 (Arcn1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | The coatomer is a cytosolic protein complex that binds to dilysine motifs and reversibly associates with Golgi non- clathrin-coated vesicles, which further mediate biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network. Coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins. In mammals, the coatomer can only be recruited by membranes associated to ADP-ribosylation factors (ARFs), which are small GTP-binding proteins; the complex also influences the Golgi structural integrity, as well as the processing, activity, and endocytic recycling of LDL receptors (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Golgi apparatus membrane {ECO:0000250}; Peripheral membrane protein {ECO:0000250}; Cytoplasmic side {ECO:0000250}. Cytoplasmic vesicle, COPI-coated vesicle membrane {ECO:0000250}; Peripheral membrane protein {ECO:0000250}; Cytoplasmic side {ECO:0000250}. Note=The coatomer is cytoplasmic or polymerized on the cytoplasmic side of the Golgi, as well as on the vesicles/buds originating from it. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2387591 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR008968
Clathrin adaptor, mu subunit, C-terminal IPR011012 Longin-like domain IPR022775 AP complex, mu/sigma subunit IPR028565 Mu homology domain |
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PFAM |
PF00928
PF01217 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q5XJY5 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q5XJY5 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8R1S6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 213827 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.476822 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_666097 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Arcn1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40602 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK028556 AK170005 BC017124 BC023728 BC024127 BC033387 BC034754 BC083152 CH466522 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH17124 AAH23728 AAH24127 AAH33387 AAH34754 AAH83152 BAC26007 BAE41508 EDL25614 | ||||||||||||||||||||||