Mus musculus Gene: Arcn1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-158210.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Arcn1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | archain 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032096 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
archain 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000095139:
This gene maps in a region, which include the mixed lineage leukemia and Friend leukemia virus integration 1 genes, where multiple disease-associated chromosome translocations occur. It is an intracellular protein. Archain sequences are well conserved among eukaryotes and this protein may play a fundamental role in eukaryotic cell biology. It has similarities to heat shock proteins and clathrin-associated proteins, and may be involved in vesicle structure or trafficking. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:44741564-44767845 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A5.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Membrane Trafficking pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
COPI Mediated Transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
COPI Mediated Transport pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
Membrane Trafficking pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
COPI Mediated Transport pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q5XJY5 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3TDU1 Q8R1S6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 213827 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.371682 Mm.402278 Mm.465568 Mm.476822 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_145985 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40602 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2387591 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Arcn1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK028556 AK170005 BC017124 BC023728 BC024127 BC033387 BC034754 BC083152 CH466522 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH17124 AAH23728 AAH24127 AAH33387 AAH34754 AAH83152 BAC26007 BAE41508 EDL25614 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 213827 | ||||||||||||||||||||||