Mus musculus Protein: U2af1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-164739.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | U2af1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor (U2AF) 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2010107D16Rik; 35kDa; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000014684 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-164737 (U2af1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Plays a critical role in both constitutive and enhancer- dependent splicing by mediating protein-protein interactions and protein-RNA interactions required for accurate 3'-splice site selection. Recruits U2 snRNP to the branch point. Directly mediates interactions between U2AF2 and proteins bound to the enhancers and thus may function as a bridge between U2AF2 and the enhancer complex to recruit it to the adjacent intron (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:18758164}. Nucleus speckle {ECO:0000269PubMed:18758164}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in primary spermatocytes and elongating spermatids (at protein level). {ECO:0000269PubMed:18758164}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 91 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:98884 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR000571 Zinc finger, CCCH-type IPR003954 RNA recognition motif domain, eukaryote IPR009145 U2 auxiliary factor small subunit |
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PFAM |
PF00076
PF00642 |
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PRINTS |
PR01848
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00356 SM00361 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9D883 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9D883 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q14C24 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 108121 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_077149 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | U2af1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28611 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK008332 AK012849 AK088979 AK150872 BC002184 BC115479 BC115480 CH466640 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH02184 AAI15480 AAI15481 BAB25609 BAB28511 BAC40683 BAE29923 EDL40343 | ||||||||||||||||||||||