Mus musculus Protein: Psd | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-172699.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Psd | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | pleckstrin and Sec7 domain containing | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110007H17Rik; A930015K15; Efa6; Efa6a; mKIAA2011; Psdl; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000093729 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172695 (Psd) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Guanine nucleotide exchange factor for ARF6. Isoform 2 and isoform 3 induce cytoskeletal remodeling, but lead to distinct morphological changes in HeLa cells: isoform 2 induces cell elongation and formation of actin-rich protrusions, whereas isoform 3 promotes the formation of membrane ruffles and loss of stress fibers. {ECO:0000269PubMed:19494129}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 1: Cell membrane. Cell projection, ruffle. Note=Colocalizes with ACTN1 in membrane ruffles and central reticular structures.Isoform 2: Cell membrane. Cell projection. Note=Accumulates in microvilli-like protrusions.Isoform 3: Cell membrane. Cell projection, ruffle. Note=Colocalizes with F-actin in membrane ruffles. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 1 is highly expressed in the strata oriens, radiatum, lacunosum-moleculare of the hippocampal CA1-3 regions and the dentate molecular layer of the hippocampal formation, with lower levels detected in the neuronal cell layers and the stratum lucidum (at protein level). Highest expression detected in brain and some expression detected also in uterus, stomach, ovary and intestine, with isoform 2 being expressed at the highest levels. Not detected in tongue, thymus, spleen, lung, heart, liver and kidney. {ECO:0000269PubMed:17298598, ECO:0000269PubMed:19494129}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1920978 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000904
Sec7 domain IPR001605 Pleckstrin homology domain, spectrin-type IPR001849 Pleckstrin homology domain |
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PFAM |
PF01369
PF00169 |
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PRINTS |
PR00683
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00222
SM00233 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q5DTT2 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q5DTT2 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 73728 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.487512 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006527449 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Psd | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC114539 AK158851 AK220438 BC058352 BC138652 BC145352 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH58352 AAI38653 AAI45353 BAD90268 BAE34694 | ||||||||||||||||||||||