Homo sapiens Protein: KDR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-19165.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD309; FLK1; VEGFR; VEGFR2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000263923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-19161 (KDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Tyrosine-protein kinase that acts as a cell-surface receptor for VEGFA, VEGFC and VEGFD. Plays an essential role in the regulation of angiogenesis, vascular development, vascular permeability, and embryonic hematopoiesis. Promotes proliferation, survival, migration and differentiation of endothelial cells. Promotes reorganization of the actin cytoskeleton. Isoforms lacking a transmembrane domain, such as isoform 2 and isoform 3, may function as decoy receptors for VEGFA, VEGFC and/or VEGFD. Isoform 2 plays an important role as negative regulator of VEGFA- and VEGFC-mediated lymphangiogenesis by limiting the amount of free VEGFA and/or VEGFC and preventing their binding to FLT4. Modulates FLT1 and FLT4 signaling by forming heterodimers. Binding of vascular growth factors to isoform 1 leads to the activation of several signaling cascades. Activation of PLCG1 leads to the production of the cellular signaling molecules diacylglycerol and inositol 1,4,5-trisphosphate and the activation of protein kinase C. Mediates activation of MAPK1/ERK2, MAPK3/ERK1 and the MAP kinase signaling pathway, as well as of the AKT1 signaling pathway. Mediates phosphorylation of PIK3R1, the regulatory subunit of phosphatidylinositol 3-kinase, reorganization of the actin cytoskeleton and activation of PTK2/FAK1. Required for VEGFA-mediated induction of NOS2 and NOS3, leading to the production of the signaling molecule nitric oxide (NO) by endothelial cells. Phosphorylates PLCG1. Promotes phosphorylation of FYN, NCK1, NOS3, PIK3R1, PTK2/FAK1 and SRC. {ECO:0000269PubMed:10102632, ECO:0000269PubMed:10368301, ECO:0000269PubMed:10600473, ECO:0000269PubMed:11387210, ECO:0000269PubMed:12649282, ECO:0000269PubMed:1417831, ECO:0000269PubMed:15026417, ECO:0000269PubMed:15215251, ECO:0000269PubMed:15962004, ECO:0000269PubMed:16966330, ECO:0000269PubMed:17303569, ECO:0000269PubMed:18529047, ECO:0000269PubMed:19668192, ECO:0000269PubMed:19834490, ECO:0000269PubMed:20080685, ECO:0000269PubMed:20224550, ECO:0000269PubMed:20705758, ECO:0000269PubMed:21893193, ECO:0000269PubMed:7929439, ECO:0000269PubMed:9160888, ECO:0000269PubMed:9804796, ECO:0000269PubMed:9837777}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 1: Cell membrane; Single-pass type I membrane protein. Cytoplasm. Nucleus. Cytoplasmic vesicle. Early endosome. Note=Detected on caveolae-enriched lipid rafts at the cell surface. Is recycled from the plasma membrane to endosomes and back again. Phosphorylation triggered by VEGFA binding promotes internalization and subsequent degradation. VEGFA binding triggers internalization and translocation to the nucleus.Cell junction {ECO:0000250}. Note=Localized with RAP1A at cell-cell junctions. {ECO:0000250}.Isoform 2: Secreted {ECO:0000305}.Isoform 3: Secreted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Hemangioma, capillary infantile (HCI) [MIM:602089]: A condition characterized by dull red, firm, dome-shaped hemangiomas, sharply demarcated from surrounding skin, usually presenting at birth or occurring within the first two or three months of life. They result from highly proliferative, localized growth of capillary endothelium and generally undergo regression and involution without scarring. {ECO:0000269PubMed:11807987, ECO:0000269PubMed:18931684}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry.Note=Plays a major role in tumor angiogenesis. In case of HIV-1 infection, the interaction with extracellular viral Tat protein seems to enhance angiogenesis in Kaposi's sarcoma lesions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in cornea (at protein level). Widely expressed. {ECO:0000269PubMed:19668192}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 62 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000719
Protein kinase domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR002290 Serine/threonine/dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR003598 Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR009136 Vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGFR2) IPR011009 Protein kinase-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin IPR013162 CD80-like, immunoglobulin C2-set IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain |
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PFAM |
PF00069
PF07714 PF07679 PF07686 PF00047 PF08205 |
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PRINTS |
PR00109
PR01834 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00220
SM00408 SM00409 SM00219 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P35968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P35968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B4DEK3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.479756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 191306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC021220 AC111194 AF035121 AF063658 AK293668 BC131822 CH471057 EU826563 FJ899739 L04947 X61656 X89776 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA59459 AAB88005 AAC16450 AAI31823 ACF47599 ACR78514 BAG57114 CAA43837 CAA61916 EAX05462 EAX05463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||