Mus musculus Protein: Ephb1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-193784.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ephb1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Eph receptor B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000082261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-193780 (Ephb1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Receptor tyrosine kinase which binds promiscuously transmembrane ephrin-B family ligands residing on adjacent cells, leading to contact-dependent bidirectional signaling into neighboring cells. The signaling pathway downstream of the receptor is referred to as forward signaling while the signaling pathway downstream of the ephrin ligand is referred to as reverse signaling. Cognate/functional ephrin ligands for this receptor include EFNB1, EFNB2 and EFNB3. During nervous system development, regulates retinal axon guidance redirecting ipsilaterally ventrotemporal retinal ganglion cells axons at the optic chiasm midline. This probably requires repulsive interaction with EFNB2. In the adult nervous system together with EFNB3, regulates chemotaxis, proliferation and polarity of the hippocampus neural progenitors. In addition to its role in axon guidance plays also an important redundant role with other ephrin-B receptors in development and maturation of dendritic spines and synapse formation. May also regulate angiogenesis. More generally, may play a role in targeted cell migration and adhesion. Upon activation by EFNB1 and probably other ephrin-B ligands activates the MAPK/ERK and the JNK signaling cascades to regulate cell migration and adhesion respectively. {ECO:0000269PubMed:12971893, ECO:0000269PubMed:14691139, ECO:0000269PubMed:18057206, ECO:0000269PubMed:18524895}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000250}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000250}. Early endosome membrane {ECO:0000250}. Cell projection, dendrite {ECO:0000269PubMed:14691139}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in neural stem and progenitor cells in the dentate gyrus. {ECO:0000269PubMed:18057206}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 16 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1096337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000719
Protein kinase domain IPR001090 Ephrin receptor ligand binding domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR001660 Sterile alpha motif domain IPR002290 Serine/threonine- /dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR003961 Fibronectin, type III IPR008979 Galactose-binding domain-like IPR009030 Insulin-like growth factor binding protein, N-terminal IPR011009 Protein kinase-like domain IPR011510 Sterile alpha motif, type 2 IPR013761 Sterile alpha motif/pointed domain IPR016257 Ephrin receptor type-A /type-B IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain IPR021129 Sterile alpha motif, type 1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00069
PF01404 PF07714 PF00041 PF01108 PF07647 PF00536 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00109
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF000666
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00615
SM00454 SM00220 SM00060 SM00219 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8CBF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8CBF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 270190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.483554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001161768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ephb1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS52901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC109247 AC132684 AC156635 AK036148 AK036211 AK135018 BC057301 CT025594 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH57301 BAC29320 BAC29348 BAE22386 CAM23741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||