Mus musculus Gene: Ephb1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-193780.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ephb1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Eph receptor B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Eph receptor B1
Eph receptor B1
Eph receptor B1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000154928:
Ephrin receptors and their ligands, the ephrins, mediate numerous developmental processes, particularly in the nervous system. Based on their structures and sequence relationships, ephrins are divided into the ephrin-A (EFNA) class, which are anchored to the membrane by a glycosylphosphatidylinositol linkage, and the ephrin-B (EFNB) class, which are transmembrane proteins. The Eph family of receptors are divided into 2 groups based on the similarity of their extracellular domain sequences and their affinities for binding ephrin-A and ephrin-B ligands. Ephrin receptors make up the largest subgroup of the receptor tyrosine kinase (RTK) family. The protein encoded by this gene is a receptor for ephrin-B family members. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:101922128-102354693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 16 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
Ephrin signaling pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Developmental Biology pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Axon guidance pathway
Ephrin signaling pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
EPHB forward signaling
EphrinB-EPHB pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8CBF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 270190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.483554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_173447 NM_001168296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40742 CCDS52901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1096337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ephb1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC109247 AC132684 AC156635 AK036148 AK036211 AK135018 BC057301 CT025594 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH57301 BAC29320 BAC29348 BAE22386 CAM23741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 270190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||