Mus musculus Protein: 1190005F20Rik | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-198080.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | 1190005F20Rik | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RIKEN cDNA 1190005F20 gene | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1190005F20Rik; AW226554; C1orf25; Trm1-like; Trm1l; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000068309 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-198078 (1190005F20Rik) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May play a role in motor coordination and exploratory behavior. {ECO:0000269PubMed:17198746}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | |||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in various neuronal structures during embryonic development, including spinal ganglia, trigeminal nerve and ganglion, olfactory and nasopharyngeal epithelium, nuclei of the metencephalon, thalamus and medulla oblongata. Also expressed in lung, esophagus, epiglottis, ependyma, vertebral column, spinal cord and brown adipose tissue. Expression persists in the adult brain with dynamically changing patterns in cortex and cerebellum. {ECO:0000269PubMed:17198746}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1916185 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002905
tRNA methyltransferase, Trm1 IPR003402 tRNA transferase Trm5/Tyw2 IPR015880 Zinc finger, C2H2-like IPR029063 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase-like |
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PFAM |
PF02005
PF02475 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00355
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | A2RSY6 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-A2RSY6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 98685 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_081152 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Trmt1l | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15361 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK004493 AK088077 AK146088 AK148524 BC022682 BC037478 BC110425 BC132299 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH22682 AAH37478 AAI10426 AAI32300 BAB23331 BAC40131 BAE26891 BAE28600 | ||||||||||||||||||||||