Mus musculus Protein: Scap | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-202001.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Scap | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | SREBF chaperone | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000095953 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-201997 (Scap) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Escort protein required for cholesterol as well as lipid homeostasis. Regulates export of the SCAP/SREBF complex from the ER upon low cholesterol. Formation of a ternary complex with INSIG at high sterol concentrations leads to masking of an ER-export signal in SCAP and retention of the complex in the ER. Low sterol concentrations trigger release of INSIG, a conformational change in the SSC domain of SCAP, unmasking of the ER export signal, recruitment into COPII-coated vesicles, transport to the Golgi complex, proteolytic cleavage of SREBF in the Golgi, release of the transcription factor fragment of SREBF from the membrane, its import into the nucleus and up-regulation of LDLR, INSIG1 and the mevalonate pathway. {ECO:0000250UniProtKB:P97260, ECO:0000269PubMed:11358865, ECO:0000269PubMed:9854040}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endoplasmic reticulum membrane {ECO:0000250UniProtKB:P97260}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000250UniProtKB:P97260}. Golgi apparatus membrane {ECO:0000250UniProtKB:P97260}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000250UniProtKB:P97260}. Cytoplasmic vesicle, COPII-coated vesicle membrane {ECO:0000250UniProtKB:P97260}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000250UniProtKB:P97260}. Note=Moves from the endoplasmic reticulum to the Golgi in the absence of sterols. {ECO:0000250UniProtKB:P97260}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2135958 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000731
Sterol-sensing domain IPR001680 WD40 repeat IPR003392 Patched IPR017986 WD40-repeat-containing domain |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00400
PF02460 |
||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00320
|
||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6GQT6 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6GQT6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z1Q4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 235623 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001096632 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Scap | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23564 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC160104 AK146658 AK150275 AK152478 AK153330 AK172912 BC051066 BC055472 BC069955 BC070437 BC072633 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH51066 AAH55472 AAH69955 AAH70437 AAH72633 BAD32190 BAE27338 BAE29431 BAE31252 BAE31909 | ||||||||||||||||||||||