Mus musculus Protein: Ddx42 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-213409.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ddx42 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 42 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1810047H21Rik; AW319508; AW556242; B430002H05Rik; RHELP; RNAHP; SF3b125; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000021046 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-213407 (Ddx42) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | ATP-dependent RNA helicase. Binds to partially double- stranded RNAs (dsRNAs) in order to unwind RNA secondary structures. Unwinding is promoted in the presence of single-strand binding proteins. Mediates also RNA duplex formation thereby displacing the single-strand RNA binding protein. ATP and ADP modulate its activity: ATP binding and hydrolysis by DDX42 triggers RNA strand separation, whereas the ADP-bound form of the protein triggers annealing of complementary RNA strands. Involved in the survival of cells by interacting with TP53BP2 and thereby counteracting the apoptosis-stimulating activity of TP53BP2. Relocalizes TP53BP2 to the cytoplasm (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus speckle {ECO:0000250}. Nucleus, Cajal body {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1919297 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR011545 DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014014 RNA helicase, DEAD-box type, Q motif IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00270 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q810A7 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q810A7 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9CTM9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 72047 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.473458 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_082350 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ddx42 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS48956 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK007805 AK021013 AK049311 AK169816 AK171730 AL604045 BC043036 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH43036 BAB25270 BAB32277 BAC33675 BAE41388 BAE42635 CAM23778 | ||||||||||||||||||||||