Homo sapiens Protein: SDR16C5 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-22542.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SDR16C5 | ||||||||||||||||||
Protein Name | short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 5 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000307607 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-22540 (SDR16C5) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Oxidoreductase with strong preference for NAD. Active in both the oxidative and reductive directions. Oxidizes all-trans- retinol in all-trans-retinaldehyde. No activity was detected with 11-cis-retinol or 11-cis-retinaldehyde as substrates with either NAD(+)/NADH or NADP(+)/NADPH. {ECO:0000269PubMed:18926804}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endoplasmic reticulum membrane {ECO:0000305}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in adult lung. Detected at low levels in adult brain, heart, testis, placenta, cervix, pancreas, uterus, stomach, rectum, small intestine, colon, esophagus, thymus, skin, and skin keratinocyte. Expression is higher in psoriasis lesions relative to unaffected skin from psoriasis patients. Detected in fetal kidney, skin and lung. {ECO:0000269PubMed:12372410}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002198
Short-chain dehydrogenase/reductase SDR IPR002347 Glucose/ribitol dehydrogenase IPR013968 Polyketide synthase, KR |
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PFAM |
PF00106
PF08659 |
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PRINTS |
PR00080
PR00081 |
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PIRSF |
PIRSF000126
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SMART | |||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q8N3Y7 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8N3Y7 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 195814 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.608211 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_620419 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:30311 | ||||||||||||||||||
OMIM | 608989 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6167 | ||||||||||||||||||
HPRD | 12351 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB083038 AK057667 AK294634 AY444559 BC037219 BC064525 CH471068 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH37219 AAH64525 AAS68535 BAB71545 BAB91014 BAG57813 EAW86780 | ||||||||||||||||||