Homo sapiens Protein: TRIM39 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-237260.7 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM39 | ||||||||||||||||||
Protein Name | tripartite motif containing 39 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000379800 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-75923 (TRIM39) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase. May facilitate apoptosis by inhibiting APC/C-Cdh1-mediated poly-ubiquitination and subsequent proteasome-mediated degradation of the pro-apoptotic protein MOAP1. {ECO:0000269PubMed:19100260, ECO:0000269PubMed:22529100}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytosol {ECO:0000269PubMed:19100260}. Mitochondrion {ECO:0000269PubMed:19100260}. Note=Found predominantly in the cytosol. Partial shift from the cytosol to the mitochondria when colocalized with MOAP1. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous; highly expressed in brain, heart, kidney, liver, skeletal muscle, spleen and testis. {ECO:0000269PubMed:19100260}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 54 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR001870 B30.2/SPRY domain IPR003877 SPRY domain IPR003879 Butyrophylin-like IPR006574 SPRY-associated IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
||||||||||||||||||
PFAM |
PF00643
PF13639 PF14634 PF00622 PF13765 PF00097 |
||||||||||||||||||
PRINTS |
PR01407
|
||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00184 SM00449 SM00589 |
||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9HCM9 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9HCM9 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | A2AAZ6 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56658 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.413493 | ||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10065 | ||||||||||||||||||
OMIM | 605700 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34378 | ||||||||||||||||||
HPRD | 09298 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB046381 AB110937 AB110938 AB202089 AK292512 AL662795 AL662832 AL773535 BC007661 BC034985 BT007370 BX248580 BX927214 CH471081 CR759281 CR759928 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH07661 AAH34985 AAP36034 BAB16374 BAD13703 BAD13704 BAE78608 BAF85201 CAI17501 CAI18251 CAI41818 CAI41819 CAM25899 CAM25900 CAQ08313 CAQ08314 CAQ08383 CAQ08384 CAQ09020 CAQ09021 EAX03283 EAX03284 EAX03285 | ||||||||||||||||||