Homo sapiens Protein: SUMO1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-246050.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SUMO1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 1 (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | DAP1; GMP1; OFC10; PIC1; SENP2; SMT3; SMT3C; SMT3H3; UBL1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000376077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-78849 (SUMO1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Ubiquitin-like protein that can be covalently attached to proteins as a monomer or a lysine-linked polymer. Covalent attachment via an isopeptide bond to its substrates requires prior activation by the E1 complex SAE1-SAE2 and linkage to the E2 enzyme UBE2I, and can be promoted by E3 ligases such as PIAS1-4, RANBP2 or CBX4. This post-translational modification on lysine residues of proteins plays a crucial role in a number of cellular processes such as nuclear transport, DNA replication and repair, mitosis and signal transduction. Involved for instance in targeting RANGAP1 to the nuclear pore complex protein RANBP2. Polymeric SUMO1 chains are also susceptible to polyubiquitination which functions as a signal for proteasomal degradation of modified proteins. May also regulate a network of genes involved in palate development. {ECO:0000269PubMed:18408734, ECO:0000269PubMed:18538659, ECO:0000269PubMed:21965678, ECO:0000269PubMed:9019411, ECO:0000269PubMed:9162015}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus membrane. Nucleus speckle. Cytoplasm. Nucleus, PML body. Note=Recruited by BCL11A into the nuclear body. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Non-syndromic orofacial cleft 10 (OFC10) [MIM:613705]: A birth defect consisting of cleft lips with or without cleft palate. Cleft lips are associated with cleft palate in two-third of cases. A cleft lip can occur on one or both sides and range in severity from a simple notch in the upper lip to a complete opening in the lip extending into the floor of the nostril and involving the upper gum. {ECO:0000269PubMed:16990542}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. A chromosomal aberration involving SUMO1 is the cause of OFC10. Translocation t(2;8)(q33.1;q24.3). The breakpoint occurred in the SUMO1 gene and resulted in haploinsufficiency confirmed by protein assays. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1363 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 32 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000626
Ubiquitin-like IPR022617 Rad60/SUMO-like domain IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF00240
PF14560 PF11976 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00213
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P63165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P63165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B8ZZ67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.635713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_003343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2352 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB062294 AC079354 AK311840 BC006462 BC053528 BC066306 BT006632 CH471063 CR542147 CR542156 U38784 U61397 U67122 U72722 U83117 X99586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB39999 AAB40388 AAB40390 AAC50733 AAC50996 AAH06462 AAH53528 AAH66306 AAP35278 AAY24035 BAB93477 BAG34782 CAA67898 CAG46944 CAG46953 EAW70304 EAW70305 EAW70306 EAW70307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||