Version 5.4
| Mus musculus Protein: Kdm4d | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-249177.6 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Kdm4d | ||||||||||||||||||||||
| Protein Name | lysine (K)-specific demethylase 4D | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000111311 | ||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-134411 (Kdm4d) | ||||||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
| Function | Histone demethylase that specifically demethylates 'Lys- 9' of histone H3, thereby playing a central role in histone code. Does not demethylate histone H3 'Lys-4', H3 'Lys-27', H3 'Lys-36' nor H4 'Lys-20'. Demethylates both di- and trimethylated H3 'Lys- 9' residue, while it has no activity on monomethylated residues. Demethylation of Lys residue generates formaldehyde and succinate (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00537}. | ||||||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:3606484 | ||||||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003347
JmjC domain IPR003349 Transcription factor jumonji, JmjN |
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| PFAM |
PF02373
PF08007 PF02375 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||||||
| SMART |
SM00558
SM00545 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | Z4YLE9 | ||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 244694 | ||||||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.240457 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | |||||||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Kdm4d | ||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | |||||||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | CT485607 | ||||||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||||||