Homo sapiens Protein: CD180 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-24970.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CD180 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | CD180 molecule | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | LY64; Ly78; RP105; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000256447 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24968 (CD180) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May cooperate with MD-1 and TLR4 to mediate the innate immune response to bacterial lipopolysaccharide (LPS) in B-cells. Leads to NF-kappa-B activation. Also involved in the life/death decision of B-cells (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane; Single-pass type I membrane protein. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed mainly on mature peripherical B cells. Detected in spleen, lymph node and appendix. Not detected in pre-B and -T cells. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000483
Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR001611 Leucine-rich repeat IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype |
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PFAM |
PF01463
PF00560 PF13504 PF13855 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00082
SM00369 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q99467 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q99467 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4064 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.87205 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_005573 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6726 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602226 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3992 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03749 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC026445 AK313177 BC109069 BC109070 CH471137 D83597 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI09070 AAI09071 BAA12019 BAG35994 EAW51318 | ||||||||||||||||||||||