Mus musculus Protein: Satb2 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-251810.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Satb2 | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | special AT-rich sequence binding protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000110057 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155567 (Satb2) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Binds to DNA, at nuclear matrix- or scaffold-associated regions. Thought to recognize the sugar-phosphate structure of double-stranded DNA. Transcription factor controlling nuclear gene expression, by binding to matrix attachment regions (MARs) of DNA and inducing a local chromatin-loop remodeling. Acts as a docking site for several chromatin remodeling enzymes and also by recruiting corepressors (HDACs) or coactivators (HATs) directly to promoters and enhancers. Required for the initiation of the upper- layer neurons (UL1) specific genetic program and for the inactivation of deep-layer neurons (DL) and UL2 specific genes, probably by modulating Bcl11b expression. Repressor of Ctip2 and regulatory determinant of corticocortical connections in the developing cerebral cortex. May play an important role in palate formation. Acts as a molecular node in a transcriptional network regulating skeletal development and osteoblast differentiation. {ECO:0000269PubMed:16751105, ECO:0000269PubMed:18255030, ECO:0000269PubMed:18255031}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus matrix {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00108, ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00374}. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in cortical neurons that extend axons across the corpus callosum. Also expressed in branchial arches and in cells of the osteoblast lineage, but not in chondrocytes and osteoclasts. {ECO:0000269PubMed:16751105, ECO:0000269PubMed:18255030}. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2679336 | ||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001356
Homeobox domain IPR003350 Homeodomain protein CUT IPR009057 Homeodomain-like IPR010982 Lambda repressor-like, DNA-binding domain |
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PFAM |
PF00046
PF02376 PF13413 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00389
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8VI24 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8VI24 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q546B3 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 212712 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399699 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_631885 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Satb2 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14965 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC101777 AC131072 AF319623 AJ606045 AK129270 BC138625 BC138626 CH466548 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI38626 AAI38627 AAL37172 BAC98080 CAE54289 EDL00043 | ||||||||||||||||||||||||||