Mus musculus Gene: Satb2 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155567.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Satb2 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | special AT-rich sequence binding protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000038331 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
special AT-rich sequence binding protein 2
special AT-rich sequence binding protein 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000119042:
This gene encodes a DNA binding protein that specifically binds nuclear matrix attachment regions. The encoded protein is involved in transcription regulation and chromatin remodeling. Defects in this gene are associated with isolated cleft palate and mental retardation. Alternate splicing results in multiple transcript variants that encode the same protein. [provided by RefSeq, Feb 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:56793981-56978650 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | C1.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8VI24 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BKV4 Q546B3 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 212712 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.145599 Mm.399699 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_139146 XM_006495826 XM_006495827 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14965 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2679336 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Satb2 | ||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC101777 AC131072 AF319623 AJ606045 AK129270 BC138625 BC138626 CH466548 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI38626 AAI38627 AAL37172 BAC98080 CAE54289 EDL00043 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 212712 | ||||||||||||||||||||||||||