Mus musculus Protein: Trim71 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-257320.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trim71 | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tripartite motif-containing 71 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000107447 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-257318 (Trim71) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase that cooperates with the microRNAs (miRNAs) machinery and promotes embryonic stem cells proliferation and maintenance. Binds to miRNAs and associates with AGO2, participating in post-transcriptional repression of transcripts such as CDKN1A. Facilitates the G1-S transition to promote rapid embryonic stem cell self-renewal by repressing CDKN1A expression. Required to maintain proliferation and prevent premature differentiation of neural progenitor cells during early neural development: positively regulates FGF signaling by controlling the stability of SHCBP1. {ECO:0000269PubMed:19898466, ECO:0000269PubMed:22508726, ECO:0000269PubMed:22735451}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, P-body {ECO:0000269PubMed:19898466, ECO:0000269PubMed:22508726, ECO:0000269PubMed:22735451}. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in undifferentiated embryonic stem cells (ESCs). Expressed in the epiblast and in interfollicular epidermal stem cells during early development. Also expressed in male germ cells and in the reproductive tract. Highly expressed in neuroepithelial cells, and its expression declines as neurogenesis proceeds (at protein level). {ECO:0000269PubMed:19898466, ECO:0000269PubMed:22508726, ECO:0000269PubMed:22735451}. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2685973 | ||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001258 NHL repeat IPR001298 Filamin/ABP280 repeat IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR013017 NHL repeat, subgroup IPR014756 Immunoglobulin E-set IPR017868 Filamin/ABP280 repeat-like |
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PFAM |
PF00643
PF01436 PF13639 PF14634 PF00630 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00557 SM00184 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q1PSW8 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q1PSW8 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 636931 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.17857 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001035968 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Trim71 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40793 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DQ005956 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAY55947 | ||||||||||||||||||||||||||