Homo sapiens Protein: RAD17 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-25791.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RAD17 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RAD17 homolog (S. pombe) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CCYC; HRAD17; R24L; RAD17SP; RAD24; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000282891 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-25785 (RAD17) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Essential for sustained cell growth, maintenance of chromosomal stability, and ATR-dependent checkpoint activation upon DNA damage. Has a weak ATPase activity required for binding to chromatin. Participates in the recruitment of the RAD1-RAD9- HUS1 complex and RHNO1 onto chromatin, and in CHEK1 activation. May also serve as a sensor of DNA replication progression, and may be involved in homologous recombination. {ECO:0000269PubMed:10208430, ECO:0000269PubMed:11418864, ECO:0000269PubMed:11687627, ECO:0000269PubMed:11799063, ECO:0000269PubMed:12578958, ECO:0000269PubMed:12672690, ECO:0000269PubMed:14500819, ECO:0000269PubMed:14624239, ECO:0000269PubMed:15235112, ECO:0000269PubMed:15538388, ECO:0000269PubMed:21659603}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:10232579, ECO:0000269PubMed:10593953, ECO:0000269PubMed:11799063, ECO:0000269PubMed:12400013}. Note=Phosphorylated form redistributes to discrete nuclear foci upon DNA damage. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Overexpressed in various cancer cell lines and in colon carcinoma (at protein level). Isoform 2 and isoform 3 are the most abundant isoforms in non irradiated cells (at protein level). Ubiquitous at low levels. Highly expressed in testis, where it is expressed within the germinal epithelium of the seminiferous tubuli. Weakly expressed in seminomas (testicular tumors). {ECO:0000269PubMed:10208430, ECO:0000269PubMed:10232579, ECO:0000269PubMed:10480350, ECO:0000269PubMed:11602352, ECO:0000269PubMed:9660800}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 54 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003959
ATPase, AAA-type, core IPR018324 Checkpoint protein Rad24, fungi/metazoa IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00004
PF07724 PF13304 |
||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O75943 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O75943 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RHU1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5884 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.739163 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_579919 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9807 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 603139 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4005 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09124 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC145132 AC145146 AF017748 AF076838 AF085736 AF098533 AF098534 AF112263 AF126424 AJ001642 AJ004977 AJ131296 AJ131297 AJ131298 AJ131299 AJ131300 AJ131301 AJ131302 AJ131303 AJ131304 AJ131305 AJ131306 AJ131307 AJ131308 AK292487 AL122068 AY612854 BC032304 BX537441 CH471137 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC36334 AAC95520 AAC97950 AAC97951 AAD01620 AAD17334 AAD38878 AAH32304 AAT09763 BAF85176 CAA04894 CAA06251 CAB46364 CAB59244 CAD97683 EAW51283 EAW51284 EAW51285 EAW51286 EAW51288 | ||||||||||||||||||||||