Homo sapiens Protein: XPO1 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-293100.5 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | XPO1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | exportin 1 (CRM1 homolog, yeast) | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CRM1; emb; exp1; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000385559 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-53335 (XPO1) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Mediates the nuclear export of cellular proteins (cargos) bearing a leucine-rich nuclear export signal (NES) and of RNAs. In the nucleus, in association with RANBP3, binds cooperatively to the NES on its target protein and to the GTPase RAN in its active GTP-bound form (Ran-GTP). Docking of this complex to the nuclear pore complex (NPC) is mediated through binding to nucleoporins. Upon transit of a nuclear export complex into the cytoplasm, disassembling of the complex and hydrolysis of Ran-GTP to Ran-GDP (induced by RANBP1 and RANGAP1, respectively) cause release of the cargo from the export receptor. The directionality of nuclear export is thought to be conferred by an asymmetric distribution of the GTP- and GDP-bound forms of Ran between the cytoplasm and nucleus. Involved in U3 snoRNA transport from Cajal bodies to nucleoli. Binds to late precursor U3 snoRNA bearing a TMG cap. Several viruses, among them HIV-1, HTLV-1 and influenza A use it to export their unspliced or incompletely spliced RNAs out of the nucleus. Interacts with, and mediates the nuclear export of HIV-1 Rev and HTLV-1 Rex proteins. Involved in HTLV-1 Rex multimerization. {ECO:0000269PubMed:14612415, ECO:0000269PubMed:15574332, ECO:0000269PubMed:20921223, ECO:0000269PubMed:9311922, ECO:0000269PubMed:9323133, ECO:0000269PubMed:9837918}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus, nucleoplasm. Nucleus, Cajal body. Nucleus, nucleolus. Note=Located in the nucleoplasm, Cajal bodies and nucleoli. Shuttles between the nucleus/nucleolus and the cytoplasm. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in heart, brain, placenta, lung, liver, skeletal muscle, pancreas, spleen, thymus, prostate, testis, ovary, small intestine, colon and peripheral blood leukocytes. Not expressed in the kidney. {ECO:0000269PubMed:9049309, ECO:0000269PubMed:9368044}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 204 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001494
Importin-beta, N-terminal domain IPR013598 Exportin-1/Importin-beta-like IPR014877 CRM1 C-terminal domain IPR016024 Armadillo-type fold |
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PFAM |
PF03810
PF08389 PF08767 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00913
SM01102 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O14980 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O14980 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JV99 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7514 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.717708 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_005264601 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12825 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602559 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33205 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03975 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC016727 AK124769 AK289920 AK316481 BC032847 BX647758 CH471053 CR749840 D89729 Y08614 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH32847 AAY14949 BAA23415 BAF82609 BAG54092 BAH14852 CAA69905 CAH18695 CAH56174 EAW99993 EAW99994 | ||||||||||||||||||||||||||||