Homo sapiens Protein: NLRC4 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-294178.4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NLRC4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | NLR family, CARD domain containing 4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000385090 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-43398 (NLRC4) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Key component of inflammasomes that indirectly senses specific proteins from pathogenic bacteria and fungi and responds by assembling an inflammasome complex that promotes caspase-1 activation, cytokine production and macrophage pyroptosis. {ECO:0000269PubMed:15107016}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:11390368}. Cytoplasm, cytosol {ECO:0000250}. Note=Cytoplasmic filaments. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 2 is expressed ubiquitously, although highly expressed in lung and spleen. Isoform 1 is highly expressed in lung, followed by leukocytes especially monocytes, lymph node, colon, brain, prostate, placenta, spleen, bone marrow and fetal liver. Isoform 4 is only detected in brain. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 31 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001315
CARD domain IPR007111 NACHT nucleoside triphosphatase IPR011029 Death-like domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00619
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00114
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9NPP4 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9NPP4 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 58484 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.574741 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16412 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606831 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33174 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06014 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF376061 AK095467 AK292673 AK314762 AL121653 AL389934 AY027787 AY027788 AY027789 AY027790 AY032589 AY035391 AY358152 BC031555 CH471053 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH31555 AAK14776 AAK14777 AAK14778 AAK14779 AAK38730 AAK53443 AAK59843 AAQ88519 BAF85362 BAG37300 BAG53062 CAB97523 EAX00452 EAX00453 EAX00454 EAX00455 | ||||||||||||||||||||||||||||