Homo sapiens Protein: NLRC4 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-294181.5 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NLRC4 | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | NLR family, CARD domain containing 4 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000385428 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-43398 (NLRC4) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Key component of inflammasomes that indirectly senses specific proteins from pathogenic bacteria and fungi and responds by assembling an inflammasome complex that promotes caspase-1 activation, cytokine production and macrophage pyroptosis. {ECO:0000269PubMed:15107016}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:11390368}. Cytoplasm, cytosol {ECO:0000250}. Note=Cytoplasmic filaments. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 2 is expressed ubiquitously, although highly expressed in lung and spleen. Isoform 1 is highly expressed in lung, followed by leukocytes especially monocytes, lymph node, colon, brain, prostate, placenta, spleen, bone marrow and fetal liver. Isoform 4 is only detected in brain. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 31 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001315
CARD domain IPR007111 NACHT nucleoside triphosphatase IPR011029 Death-like domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00619
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00114
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9NPP4 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9NPP4 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 58484 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.574741 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001186067 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16412 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606831 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33174 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06014 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF376061 AK095467 AK292673 AK314762 AL121653 AL389934 AY027787 AY027788 AY027789 AY027790 AY032589 AY035391 AY358152 BC031555 CH471053 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH31555 AAK14776 AAK14777 AAK14778 AAK14779 AAK38730 AAK53443 AAK59843 AAQ88519 BAF85362 BAG37300 BAG53062 CAB97523 EAX00452 EAX00453 EAX00454 EAX00455 | ||||||||||||||||||||||||||