Homo sapiens Protein: HDAC9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-295035.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HDAC9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | histone deacetylase 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HD7; HD7b; HD9; HDAC; HDAC7; HDAC7B; HDAC9B; HDAC9FL; HDRP; MITR; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000384657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-9049 (HDAC9) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Responsible for the deacetylation of lysine residues on the N-terminal part of the core histones (H2A, H2B, H3 and H4). Histone deacetylation gives a tag for epigenetic repression and plays an important role in transcriptional regulation, cell cycle progression and developmental events. Represses MEF2-dependent transcription.Isoform 3 lacks active site residues and therefore is catalytically inactive. Represses MEF2-dependent transcription by recruiting HDAC1 and/or HDAC3. Seems to inhibit skeletal myogenesis and to be involved in heart development. Protects neurons from apoptosis, both by inhibiting JUN phosphorylation by MAPK10 and by repressing JUN transcription via HDAC1 recruitment to JUN promoter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Note=A chromosomal aberration involving HDAC9 is found in a family with Peters anomaly. Translocation t(1;7)(q41;p21) with TGFB2 resulting in lack of HDAC9 protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Broadly expressed, with highest levels in brain, heart, muscle and testis. Isoform 3 is present in human bladder carcinoma cells (at protein level). {ECO:0000269PubMed:10655483, ECO:0000269PubMed:11535832, ECO:0000269PubMed:12590135, ECO:0000269PubMed:12706107}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 117 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000286
Histone deacetylase superfamily IPR017320 Histone deacetylase class II, eukaryotic IPR023801 Histone deacetylase domain IPR024643 Histone deacetylase, glutamine rich N-terminal domain |
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PFAM |
PF00850
PF12203 |
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PRINTS |
PR01270
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PIRSF |
PIRSF037911
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SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UKV0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UKV0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8N926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.734495 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_848510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14065 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB018287 AC002088 AC002124 AC002410 AC002433 AC004744 AC004994 AC005249 AC010082 AC074193 AC091697 AF124924 AJ459808 AK095820 AK297404 AK304298 AK304343 AK304410 AY032737 AY032738 AY197371 BC111735 BC150328 BC152405 CH471073 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF04254 AAI11736 AAI50329 AAI52406 AAK66821 AAK66822 AAO27363 AAS07401 AAS07409 AAS07423 AAS07424 BAA34464 BAC04630 BAH12570 BAH14153 BAH14164 BAH14176 CAD30851 EAW93702 EAW93703 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||