Homo sapiens Protein: LTA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-371524.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | lymphotoxin alpha (TNF superfamily, member 1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LT; TNFB; TNFSF1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000403495 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-302490 (LTA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Cytokine that in its homotrimeric form binds to TNFRSF1A/TNFR1, TNFRSF1B/TNFBR and TNFRSF14/HVEM. In its heterotrimeric form with LTB binds to TNFRSF3/LTBR. Lymphotoxin is produced by lymphocytes and cytotoxic for a wide range of tumor cells in vitro and in vivo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted. Membrane. Note=The homotrimer is secreted. The heterotrimer is membrane-associated. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Psoriatic arthritis (PSORAS) [MIM:607507]: An inflammatory, seronegative arthritis associated with psoriasis. It is a heterogeneous disorder ranging from a mild, non-destructive disease to a severe, progressive, erosive arthropathy. Five types of psoriatic arthritis have been defined: asymmetrical oligoarthritis characterized by primary involvement of the small joints of the fingers or toes; asymmetrical arthritis which involves the joints of the extremities; symmetrical polyarthritis characterized by a rheumatoid like pattern that can involve hands, wrists, ankles, and feet; arthritis mutilans, which is a rare but deforming and destructive condition; arthritis of the sacroiliac joints and spine (psoriatic spondylitis). {ECO:0000269PubMed:12746914}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 18 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002960
Lymphotoxin-alpha IPR006052 Tumour necrosis factor domain IPR006053 Tumour necrosis factor IPR008983 Tumour necrosis factor-like domain |
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PFAM |
PF00229
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PRINTS |
PR01236
PR01234 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00207
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P01374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | W6A1P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001153212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 153440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB088112 AB103618 AF129756 AY070490 AY216498 AY274906 AY274908 AY274915 AY274919 AY274922 AY274923 BA000025 BC034729 CH471081 D00102 D12614 DQ123821 EU338451 KF809959 KF809961 KF809964 KF809965 KF833316 KF833317 KF833318 KF833319 M16441 M55913 X01393 X02911 Y14768 Z15026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA61199 AAB59455 AAD18092 AAH34729 AAL49956 AAO21135 AAP51424 AAP51426 AAP51433 AAP51437 AAP51440 AAP51441 AAZ32914 ACA64646 AHH34318 AHH34320 AHH34323 AHH34324 AHI45173 AHI45174 AHI45175 AHI45176 BAA00064 BAA02139 BAB63397 BAC54943 BAF31278 CAA25649 CAA26670 CAA75071 CAA78746 EAX03422 EAX03423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||