Homo sapiens Protein: FGD4 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-371544.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | FGD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000394487 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-26267 (FGD4) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Activates CDC42, a member of the Ras-like family of Rho- and Rac proteins, by exchanging bound GDP for free GTP. Plays a role in regulating the actin cytoskeleton and cell shape. Activates MAPK8 (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000250}. Cell projection, filopodium {ECO:0000250}. Note=Concentrated in filopodia and poorly detected at lamellipodia. Binds along the sides of actin fibers (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Charcot-Marie-Tooth disease 4H (CMT4H) [MIM:609311]: A recessive demyelinating form of Charcot-Marie-Tooth disease, a disorder of the peripheral nervous system, characterized by progressive weakness and atrophy, initially of the peroneal muscles and later of the distal muscles of the arms. Charcot- Marie-Tooth disease is classified in two main groups on the basis of electrophysiologic properties and histopathology: primary peripheral demyelinating neuropathies (designated CMT1 when they are dominantly inherited) and primary peripheral axonal neuropathies (CMT2). Demyelinating neuropathies are characterized by severely reduced nerve conduction velocities (less than 38 m/sec), segmental demyelination and remyelination with onion bulb formations on nerve biopsy, slowly progressive distal muscle atrophy and weakness, absent deep tendon reflexes, and hollow feet. By convention autosomal recessive forms of demyelinating Charcot-Marie-Tooth disease are designated CMT4. {ECO:0000269PubMed:17564959, ECO:0000269PubMed:17564972}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in different tissues, including brain, cerebellum, peripheral nerve, skeletal muscle, heart, uterus, placenta and testis. {ECO:0000269PubMed:17564959}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000219
Dbl homology (DH) domain IPR000306 FYVE zinc finger IPR001849 Pleckstrin homology domain IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR017455 Zinc finger, FYVE-related |
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PFAM |
PF00621
PF01363 PF00169 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00325
SM00064 SM00233 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q96M96 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q96M96 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | J3KSS3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 121512 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.117835 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_640334 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:19125 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 611104 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8727 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 16891 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC084824 AC087245 AC090440 AC090677 AK057294 AL713762 AY367054 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAQ72372 BAB71413 CAD28532 | ||||||||||||||||||||||||||||||