Homo sapiens Protein: RBCK1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-37280.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBCK1 | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | RanBP-type and C3HC4-type zinc finger containing 1 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C20orf18; HOIL-1; HOIL1; PBMEI; RBCK2; RNF54; UBCE7IP3; XAP3; XAP4; ZRANB4; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000348632 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-37270 (RBCK1) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase, which accepts ubiquitin from specific E2 ubiquitin-conjugating enzymes, such as UBE2L3/UBCM4, and then transfers it to substrates. Functions as an E3 ligase for oxidized IREB2 and both heme and oxygen are necessary for IREB2 ubiquitination. Promotes ubiquitination of TAB2 and IRF3 and their degradation by the proteasome. Component of the LUBAC complex which conjugates linear ('Met-1'-linked) polyubiquitin chains to substrates and plays a key role in NF- kappa-B activation and regulation of inflammation. LUBAC conjugates linear polyubiquitin to IKBKG and RIPK1 and is involved in activation of the canonical NF-kappa-B and the JNK signaling pathways. Linear ubiquitination mediated by the LUBAC complex interferes with TNF-induced cell death and thereby prevents inflammation. LUBAC is proposed to be recruited to the TNF-R1 signaling complex (TNF-RSC) following polyubiquitination of TNF- RSC components by BIRC2 and/or BIRC3 and to conjugate linear polyubiquitin to IKBKG and possibly other components contributing to the stability of the complex. Together with FAM105B/otulin, the LUBAC complex regulates the canonical Wnt signaling during angiogenesis. Binds polyubiquitin of different linkage types. {ECO:0000269PubMed:12629548, ECO:0000269PubMed:17006537, ECO:0000269PubMed:17449468, ECO:0000269PubMed:18711448, ECO:0000269PubMed:19136968, ECO:0000269PubMed:20005846, ECO:0000269PubMed:21455173, ECO:0000269PubMed:21455180, ECO:0000269PubMed:21455181}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | |||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 107 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000626
Ubiquitin-like IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR001876 Zinc finger, RanBP2-type IPR002867 Zinc finger, C6HC-type IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF00240
PF14560 PF13639 PF14634 PF00641 PF01485 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00213
SM00184 SM00547 SM00647 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9BYM8 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9BYM8 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5JWR1 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10616 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.732926 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_112506 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15864 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 610924 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13000 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 16643 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB107766 AL121747 BC000983 BC015219 U67322 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD00162 AAH15219 BAC75409 CAC17516 CAC28312 | ||||||||||||||||||||||||||