Homo sapiens Protein: TRIM32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-378852.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tripartite motif containing 32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BBS11; HT2A; LGMD2H; TATIP; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000408292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-82716 (TRIM32) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Has an E3 ubiquitin ligase activity. Ubiquitinates DTNBP1 (dysbindin) and promotes its degradation. May ubiquitinate BBS2. May play a significant role in mediating the biological activity of the HIV-1 Tat protein in vivo. Binds specifically to the activation domain of HIV-1 Tat and can also interact with the HIV-2 and EIAV Tat proteins in vivo. {ECO:0000269PubMed:19349376, ECO:0000269PubMed:22500027}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Note=Localized in cytoplasmic bodies, often located around the nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Limb-girdle muscular dystrophy 2H (LGMD2H) [MIM:254110]: An autosomal recessive degenerative myopathy characterized by pelvic girdle, shoulder girdle and quadriceps muscle weakness. Clinical phenotype and severity are highly variable. Disease progression is slow and most patients remain ambulatory into the sixth decade of life. {ECO:0000269PubMed:11822024, ECO:0000269PubMed:17994549}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Bardet-Biedl syndrome 11 (BBS11) [MIM:209900]: A syndrome characterized by usually severe pigmentary retinopathy, early- onset obesity, polydactyly, hypogenitalism, renal malformation and mental retardation. Secondary features include diabetes mellitus, hypertension and congenital heart disease. Bardet-Biedl syndrome inheritance is autosomal recessive, but three mutated alleles (two at one locus, and a third at a second locus) may be required for clinical manifestation of some forms of the disease. {ECO:0000269PubMed:16606853}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. It has been suggested that TRIM32 might be the E3 ubiquitin ligase for BBS2, a component of the BBSome complex involved in ciliogenesis, that is ubiquitinated and degraded by the proteasome (PubMed:22500027). {ECO:0000269PubMed:22500027}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Spleen, thymus, prostate, testis, ovary, intestine, colon and skeletal muscle. {ECO:0000269PubMed:11822024}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 77 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001258 NHL repeat IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR013017 NHL repeat, subgroup IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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PFAM |
PF00643
PF01436 PF13639 PF14634 PF00097 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00184 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q13049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q13049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5JVY0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.591910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_036342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL133284 BC003154 CH471090 U18543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA86474 AAH03154 CAB92723 EAW87446 EAW87447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||