Homo sapiens Gene: TRIM32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-82716.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif containing 32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BBS11; HT2A; LGMD2H; TATIP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000119401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif containing 32
tripartite motif containing 32
tripartite motif containing 32
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
TRIM32 targets TMEM173 for ubiquitination and enhances the induction of IFNB against RNA and DNA viruses.
TRIM32 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Trim32 targets Tmem173 for ubiquitination and enhances the induction of Ifnb against RNA and DNA viruses. (Demonstrated in human)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to cytoplasmic bodies. The protein has also been localized to the nucleus, where it interacts with the activation domain of the HIV-1 Tat protein. The Tat protein activates transcription of HIV-1 genes. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:116687302-116701300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q33.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 77 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Innate Immune System pathway
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
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KEGG |
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q13049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024R843 Q5JVY0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.591910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001099679 NM_012210 XM_005251813 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL133284 BC003154 CH471090 U18543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA86474 AAH03154 CAB92723 EAW87446 EAW87447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 22954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||