Homo sapiens Protein: SLC6A4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-38867.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC6A4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, serotonin), member 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5-HTT; 5-HTTLPR; 5HTT; hSERT; HTT; OCD1; SERT; SERT1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000261707 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-38865 (SLC6A4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Serotonin transporter whose primary function in the central nervous system involves the regulation of serotonergic signaling via transport of serotonin molecules from the synaptic cleft back into the pre-synaptic terminal for re-utilization. Plays a key role in mediating regulation of the availability of serotonin to other receptors of serotonergic systems. Terminates the action of serotonin and recycles it in a sodium-dependent manner. {ECO:0000269PubMed:17506858, ECO:0000269PubMed:18227069, ECO:0000269PubMed:19270731}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane; Multi-pass membrane protein. Endomembrane system; Multi-pass membrane protein. Endosome membrane; Multi-pass membrane protein. Note=Translocates from intracellular locations to the plasma membrane. Density of transporter molecules on the plasma membrane is itself regulated by serotonin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in platelets (at protein level). {ECO:0000269PubMed:17506858}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000175
Sodium:neurotransmitter symporter IPR013086 Sodium:neurotransmitter symporter, serotonin, N-terminal |
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PFAM |
PF00209
PF03491 |
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PRINTS |
PR00176
PR01203 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P31645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P31645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9NYN7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.29792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 182138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC104984 AF233399 AK308014 AY902473 BC069484 EU099989 EU796564 EU796569 EU796574 EU796579 EU796584 EU796589 EU796594 EU796604 EU796609 EU796614 EU796619 EU796624 L05568 U79746 X70697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35492 AAB93475 AAF61945 AAH69484 AAW80933 ABV02581 ACE96158 ACE96163 ACE96168 ACE96173 ACE96178 ACE96188 ACE96193 ACE96198 ACE96203 ACE96208 ACE96213 ACE96218 CAA50029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||