Homo sapiens Gene: SLC6A4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-38865.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC6A4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, serotonin), member 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5-HTT; 5-HTTLPR; 5HTT; hSERT; HTT; OCD1; SERT; SERT1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000108576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, serotonin), member 4
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, serotonin), member 4
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, serotonin), member 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an integral membrane protein that transports the neurotransmitter serotonin from synaptic spaces into presynaptic neurons. The encoded protein terminates the action of serotonin and recycles it in a sodium-dependent manner. This protein is a target of psychomotor stimulants, such as amphetamines and cocaine, and is a member of the sodium:neurotransmitter symporter family. A repeat length polymorphism in the promoter of this gene has been shown to affect the rate of serotonin uptake and may play a role in sudden infant death syndrome, aggressive behavior in Alzheimer disease patients, and depression-susceptibility in people experiencing emotional trauma. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:30194319-30236002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P31645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B3VRQ0 B3VRQ5 B3VRR0 B3VRR5 B3VRS0 B3VRS5 B3VRU0 B3VRU5 B3VRV0 B3VRV5 B3VRW0 J3KPR9 Q9NYN7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.134662 Hs.29792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001045 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 182138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC104984 AF233399 AK308014 AY902473 BC069484 EU099989 EU796564 EU796569 EU796574 EU796579 EU796584 EU796589 EU796594 EU796604 EU796609 EU796614 EU796619 EU796624 L05568 U79746 X70697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35492 AAB93475 AAF61945 AAH69484 AAW80933 ABV02581 ACE96158 ACE96163 ACE96168 ACE96173 ACE96178 ACE96188 ACE96193 ACE96198 ACE96203 ACE96208 ACE96213 ACE96218 CAA50029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||