Homo sapiens Protein: CD44 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-39564.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CD44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | CD44 molecule (Indian blood group) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CDW44; CSPG8; ECMR-III; HCELL; HUTCH-I; IN; LHR; MC56; MDU2; MDU3; MIC4; Pgp1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000263398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-39556 (CD44) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Receptor for hyaluronic acid (HA). Mediates cell-cell and cell-matrix interactions through its affinity for HA, and possibly also through its affinity for other ligands such as osteopontin, collagens, and matrix metalloproteinases (MMPs). Adhesion with HA plays an important role in cell migration, tumor growth and progression. In cancer cells, may play an important role in invadopodia formation. Also involved in lymphocyte activation, recirculation and homing, and in hematopoiesis. Altered expression or dysfunction causes numerous pathogenic phenotypes. Great protein heterogeneity due to numerous alternative splicing and post-translational modification events. {ECO:0000269PubMed:16541107}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane; Single-pass type I membrane protein. Note=Colocalizes with actin in membrane protrusions at wounding edges. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 10 (epithelial isoform) is expressed by cells of epithelium and highly expressed by carcinomas. Expression is repressed in neuroblastoma cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 60 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000538
Link IPR001231 CD44 antigen IPR016187 C-type lectin fold |
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PFAM |
PF00193
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PRINTS |
PR01265
PR00658 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00445
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P16070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P16070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PKC6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 960 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.733491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001001391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1681 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 107269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB462491 AB469006 AB469162 AF098641 AJ251595 AL133330 AL136989 AL356215 AL832642 AY101192 AY101193 BC004372 BC067348 CH471064 EF581837 FJ216964 L05407 L05408 L05409 L05410 L05411 L05412 L05414 L05415 L05416 L05417 L05418 L05419 L05420 L05421 L05422 L05423 L05424 M24915 M25078 M59040 M69215 S66400 S72928 U40373 X55150 X55938 X56794 X62739 X66733 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35674 AAA36138 AAA51950 AAA82949 AAB13622 AAB13623 AAB13624 AAB13625 AAB13626 AAB13627 AAB13628 AAB27917 AAB27918 AAB27919 AAB30429 AAC70782 AAH04372 AAH67348 AAM50040 AAM50041 ABQ59315 ACI46596 BAH30705 BAH57528 BAH57857 CAA38951 CAA39404 CAA40133 CAA44602 CAA47271 CAB61878 CAC10347 CAD89965 EAW68147 EAW68148 EAW68149 EAW68151 EAW68152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||