Mus musculus Protein: Smc2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-400956.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smc2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | structural maintenance of chromosomes 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5730502P04Rik; AI255214; AW545314; CAP-E; CAPE; Fin16; SMC-2; Smc2l1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000113940 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-147370 (Smc2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Central component of the condensin complex, a complex required for conversion of interphase chromatin into mitotic-like condense chromosomes. The condensin complex probably introduces positive supercoils into relaxed DNA in the presence of type I topoisomerases and converts nicked DNA into positive knotted forms in the presence of type II topoisomerases (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Chromosome {ECO:0000250}. Note=In interphase cells, the majority of the condensin complex is found in the cytoplasm, while a minority of the complex is associated with chromatin. A subpopulation of the complex however remains associated with chromosome foci in interphase cells. During mitosis, most of the condensin complex is associated with the chromatin. At the onset of prophase, the regulatory subunits of the complex are phosphorylated by CDC2, leading to condensin's association with chromosome arms and to chromosome condensation. Dissociation from chromosomes is observed in late telophase (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 33 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:106067 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003395
RecF/RecN/SMC, N-terminal IPR010935 SMCs flexible hinge IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF02463
PF06470 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00968
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8CG48 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8CG48 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1AWH6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 14211 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.461800 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_032043 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 3L51 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Smc2 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18180 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ534939 AK013109 AK019977 AL732619 BC094380 CH466565 U42385 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB08867 AAH94380 BAB28654 BAB31946 CAD59182 CAM14006 EDL02299 | ||||||||||||||||||||||