Homo sapiens Protein: LIG3 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-40896.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LIG3 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | ligase III, DNA, ATP-dependent | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LIG2; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000367787 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-40894 (LIG3) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Interacts with DNA-repair protein XRCC1 and can correct defective DNA strand-break repair and sister chromatid exchange following treatment with ionizing radiation and alkylating agents. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Testis, thymus, prostate and heart. | ||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 29 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000977
DNA ligase, ATP-dependent IPR001357 BRCT domain IPR001510 Zinc finger, PARP-type IPR012308 DNA ligase, ATP-dependent, N-terminal IPR012309 DNA ligase, ATP-dependent, C-terminal IPR012310 DNA ligase, ATP-dependent, central IPR012340 Nucleic acid-binding, OB-fold |
||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00533
PF12738 PF00645 PF04675 PF04679 PF01068 |
||||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00292
|
||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P49916 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P49916 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7EQB6 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3980 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.100299 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_039269 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6600 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600940 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11284 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02966 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB470625 AC004223 AC022903 AF491645 AK300363 BC068005 CH471147 HQ204826 HQ204827 HQ204828 HQ204829 HQ204830 HQ204831 HQ204832 HQ204833 HQ204834 HQ204835 HQ204836 HQ204837 HQ204838 HQ204839 HQ204840 HQ204841 HQ204842 HQ204843 HQ204844 HQ204845 HQ204846 HQ204847 HQ204848 HQ204849 HQ204850 HQ204851 HQ204852 HQ204853 HQ204854 HQ204855 HQ204856 HQ204857 HQ204858 HQ204859 HQ204860 HQ204861 HQ204862 HQ204863 HQ204864 HQ204865 U40671 X84740 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA85022 AAH68005 AAL91592 ADP89974 ADP89976 ADP89978 ADP89980 ADP89982 ADP89984 ADP89986 ADP89988 ADP89990 ADP89992 ADP89994 ADP89996 ADP89998 ADP90000 ADP90002 ADP90004 ADP90006 ADP90008 ADP90010 ADP90012 ADP90014 ADP90016 ADP90018 ADP90020 ADP90022 ADP90024 ADP90026 ADP90028 ADP90030 ADP90032 ADP90034 ADP90036 ADP90038 ADP90040 ADP90042 ADP90044 ADP90046 ADP90048 ADP90050 ADP90052 BAH13269 BAH59593 CAA59230 EAW80199 | ||||||||||||||||||||||||