Homo sapiens Protein: SLITRK1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-41482.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLITRK1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | SLIT and NTRK-like family, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000366288 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-41480 (SLITRK1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Enhances neuronal dendrite outgrowth. {ECO:0000269PubMed:16224024}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Gilles de la Tourette syndrome (GTS) [MIM:137580]: Neurologic disorder manifested particularly by motor and vocal tics and associated with behavioral abnormalities. {ECO:0000269PubMed:16224024}. Note=The disease may be caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Trichotillomania (TTM) [MIM:613229]: A neuropsychiatric disorder characterized by chronic, repetitive, or compulsive hair pulling resulting in noticeable hair loss. Affected individuals may develop physical complications and often have overlapping psychological disorders, such as Gilles de la Tourette syndrome or obsessive-compulsive disorder. {ECO:0000269PubMed:16224024}. Note=The disease may be caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed predominantly in the frontal lobe of the cerebral cortex of the brain. Also expressed in some astrocytic brain tumors such as astrocytomas, oligodendrogliomas, glioblastomas, gangliogliomas and primitive neuroectodermal tumors. {ECO:0000269PubMed:14557068}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000483
Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR001611 Leucine-rich repeat IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype |
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PFAM |
PF01463
PF00560 PF13504 PF13855 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00082
SM00369 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q96PX8 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q96PX8 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 114798 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.627477 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_443142 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20297 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 609678 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9464 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 18063 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB067497 AL355481 AY358289 BC051738 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH51738 AAQ88656 BAB67803 CAC37488 | ||||||||||||||||||||||