Homo sapiens Gene: SLITRK1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-41480.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLITRK1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | SLIT and NTRK-like family, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000178235 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SLIT and NTRK-like family, member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This intronless gene encodes a member of the SLITRK protein family. These proteins are integral membrane proteins that are characterized by two N-terminal leucine-rich repeat (LRR) domains and a C-terminal region that shares homology with trk neurotrophin receptors. However, the protein encoded by this gene lacks the region of homology to neurotrophin receptors. The protein is thought to be involved in neurite outgrowth. Mutations in this gene may be associated with Tourette syndrome.[provided by RefSeq, Mar 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:83877205-83882393 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q31.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q96PX8 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 114798 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.415478 Hs.627477 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001281503 NM_052910 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20297 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 609678 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9464 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB067497 AL355481 AY358289 BC051738 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH51738 AAQ88656 BAB67803 CAC37488 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 114798 | ||||||||||||||||||||||