Homo sapiens Protein: RAD50 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-42353.7 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RAD50 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | RAD50 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | hRad50; NBSLD; RAD502; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000368100 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-42351 (RAD50) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Component of the MRN complex, which plays a central role in double-strand break (DSB) repair, DNA recombination, maintenance of telomere integrity and meiosis. The complex possesses single-strand endonuclease activity and double-strand- specific 3'-5' exonuclease activity, which are provided by MRE11A. RAD50 may be required to bind DNA ends and hold them in close proximity. This could facilitate searches for short or long regions of sequence homology in the recombining DNA templates, and may also stimulate the activity of DNA ligases and/or restrict the nuclease activity of MRE11A to prevent nucleolytic degradation past a given point. The complex may also be required for DNA damage signaling via activation of the ATM kinase. In telomeres the MRN complex may modulate t-loop formation. {ECO:0000269PubMed:10888888, ECO:0000269PubMed:11741547, ECO:0000269PubMed:15064416, ECO:0000269PubMed:9590181, ECO:0000269PubMed:9651580, ECO:0000269PubMed:9705271}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Chromosome, telomere. Note=Localizes to discrete nuclear foci after treatment with genotoxic agents. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Nijmegen breakage syndrome-like disorder (NBSLD) [MIM:613078]: A disorder similar to Nijmegen breakage syndrome and characterized by chromosomal instability, radiation sensitivity, microcephaly, growth retardation, short stature and bird-like face. Immunodeficiency is absent. {ECO:0000269PubMed:19409520}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed at very low level in most tissues, except in testis where it is expressed at higher level. Expressed in fibroblasts. {ECO:0000269PubMed:8756642}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 110 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004584
DNA repair protein Rad50, eukaryotes IPR007517 Rad50 zinc hook IPR009053 Prefoldin IPR013134 Zinc hook, Rad50 IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF04423
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q92878 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q92878 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JNH8 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10111 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.674411 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_005723 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9816 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 604040 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34233 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04950 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC004041 AC004042 AC116366 AF057299 AF057300 AK290597 BC062603 BC073850 BC136436 CH471062 U63139 Z75311 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB07119 AAD50325 AAD50326 AAH62603 AAH73850 AAI36437 BAF83286 CAA99729 EAW62329 | ||||||||||||||||||||||||||||