Homo sapiens Protein: BRAF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-44353.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BRAF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | v-raf murine sarcoma viral oncogene homolog B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | B-RAF1; BRAF1; NS7; RAFB1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000288602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-44351 (BRAF) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Protein kinase involved in the transduction of mitogenic signals from the cell membrane to the nucleus. May play a role in the postsynaptic responses of hippocampal neuron. Phosphorylates MAP2K1, and thereby contributes to the MAP kinase signal transduction pathway. {ECO:0000269PubMed:21441910}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm. Cell membrane {ECO:0000250}. Note=Colocalizes with RGS14 and RAF1 in both the cytoplasm and membranes. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Note=Defects in BRAF are found in a wide range of cancers. {ECO:0000269PubMed:18974108}.Colorectal cancer (CRC) [MIM:114500]: A complex disease characterized by malignant lesions arising from the inner wall of the large intestine (the colon) and the rectum. Genetic alterations are often associated with progression from premalignant lesion (adenoma) to invasive adenocarcinoma. Risk factors for cancer of the colon and rectum include colon polyps, long-standing ulcerative colitis, and genetic family history. {ECO:0000269PubMed:12198537, ECO:0000269PubMed:23263490}. Note=The disease may be caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Lung cancer (LNCR) [MIM:211980]: A common malignancy affecting tissues of the lung. The most common form of lung cancer is non-small cell lung cancer (NSCLC) that can be divided into 3 major histologic subtypes: squamous cell carcinoma, adenocarcinoma, and large cell lung cancer. NSCLC is often diagnosed at an advanced stage and has a poor prognosis. {ECO:0000269PubMed:12460919}. Note=The gene represented in this entry is involved in disease pathogenesis.Familial non-Hodgkin lymphoma (NHL) [MIM:605027]: Cancer that starts in cells of the lymph system, which is part of the body's immune system. NHLs can occur at any age and are often marked by enlarged lymph nodes, fever and weight loss. {ECO:0000269PubMed:14612909}. Note=The gene represented in this entry is involved in disease pathogenesis.Cardiofaciocutaneous syndrome 1 (CFC1) [MIM:115150]: A multiple congenital anomaly disorder characterized by a distinctive facial appearance, heart defects and mental retardation. Heart defects include pulmonic stenosis, atrial septal defects and hypertrophic cardiomyopathy. Some affected individuals present with ectodermal abnormalities such as sparse, friable hair, hyperkeratotic skin lesions and a generalized ichthyosis-like condition. Typical facial features are similar to Noonan syndrome. They include high forehead with bitemporal constriction, hypoplastic supraorbital ridges, downslanting palpebral fissures, a depressed nasal bridge, and posteriorly angulated ears with prominent helices. {ECO:0000269PubMed:16439621, ECO:0000269PubMed:16474404, ECO:0000269PubMed:18042262, ECO:0000269PubMed:19206169}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Noonan syndrome 7 (NS7) [MIM:613706]: A form of Noonan syndrome, a disease characterized by short stature, facial dysmorphic features such as hypertelorism, a downward eyeslant and low-set posteriorly rotated ears, and a high incidence of congenital heart defects and hypertrophic cardiomyopathy. Other features can include a short neck with webbing or redundancy of skin, deafness, motor delay, variable intellectual deficits, multiple skeletal defects, cryptorchidism, and bleeding diathesis. Individuals with Noonan syndrome are at risk of juvenile myelomonocytic leukemia, a myeloproliferative disorder characterized by excessive production of myelomonocytic cells. {ECO:0000269PubMed:19206169}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.LEOPARD syndrome 3 (LEOPARD3) [MIM:613707]: A disorder characterized by lentigines, electrocardiographic conduction abnormalities, ocular hypertelorism, pulmonic stenosis, abnormalities of genitalia, retardation of growth, and sensorineural deafness. {ECO:0000269PubMed:19206169}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Note=A chromosomal aberration involving BRAF is found in pilocytic astrocytomas. A tandem duplication of 2 Mb at 7q34 leads to the expression of a KIAA1549-BRAF fusion protein with a constitutive kinase activity and inducing cell transformation. {ECO:0000269PubMed:18974108}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Brain and testis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 70 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000719
Protein kinase domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR002219 Protein kinase C-like, phorbol ester/diacylglycerol-binding domain IPR002290 Serine/threonine/dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR003116 Raf-like Ras-binding IPR011009 Protein kinase-like domain IPR020454 Diacylglycerol/phorbol-ester binding IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF00069
PF07714 PF00130 PF02196 |
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PRINTS |
PR00109
PR00008 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00109
SM00220 SM00455 SM00219 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P15056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P15056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q75MQ8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.613773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1097 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 164757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC006006 AC006344 AC006347 AM989472 AM989473 AM989474 AM989475 AM989476 AM989477 BC101757 BC112079 CH236950 EU600171 GU149303 HM459603 M21001 M95712 X65187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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