Homo sapiens Protein: U2AF1L4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-45156.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | U2AF1L4 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1-like 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000292879 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-45152 (U2AF1L4) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA-binding protein that function as a pre-mRNA splicing factor. Plays a critical role in both constitutive and enhancer- dependent splicing by mediating protein-protein interactions and protein-RNA interactions required for accurate 3'-splice site selection. Acts by enhancing the binding of U2AF2 to weak pyrimidine tracts. Also participates in the regulation of alternative pre-mRNA splicing. Activates exon 5 skipping of PTPRC during T-cell activation; an event reversed by GFI1. Binds to RNA at the AG dinucleotide at the 3'-splice site (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Nucleus speckle {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 2 is widely expressed. Isoform 3 is highly expressed in heart, brain and lung, lower expressed in thymus and much lower expressed in peripheral blood leukocytes. {ECO:0000269PubMed:17312947}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR000571 Zinc finger, CCCH-type IPR003954 RNA recognition motif domain, eukaryote IPR009145 U2 auxiliary factor small subunit |
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PFAM |
PF00076
PF00642 |
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PRINTS |
PR01848
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00356 SM00361 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8WU68 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8WU68 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 199746 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.351558 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_659424 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:23020 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 601080 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12473 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03050 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AD000671 AY569437 BC021186 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH21186 AAT72770 | ||||||||||||||||||||||