Homo sapiens Protein: UBR5 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-479178.4 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | UBR5 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000429084 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-31165 (UBR5) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase which is a component of the N-end rule pathway. Recognizes and binds to proteins bearing specific N-terminal residues that are destabilizing according to the N-end rule, leading to their ubiquitination and subsequent degradation (By similarity). Involved in maturation and/or transcriptional regulation of mRNA by activating CDK9 by polyubiquitination. May play a role in control of cell cycle progression. May have tumor suppressor function. Regulates DNA topoisomerase II binding protein (TopBP1) in the DNA damage response. Plays an essential role in extraembryonic development. Ubiquitinates acetylated PCK1. Also acts as a regulator of DNA damage response by acting as a suppressor of RNF168, an E3 ubiquitin-protein ligase that promotes accumulation of 'Lys-63'- linked histone H2A and H2AX at DNA damage sites, thereby acting as a guard against excessive spreading of ubiquitinated chromatin at damaged chromosomes. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:21127351, ECO:0000269PubMed:21726808, ECO:0000269PubMed:22884692}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. Most abundant in testis and expressed at high levels in brain, pituitary and kidney. | ||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 126 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000569
HECT IPR002004 Polyadenylate-binding protein/Hyperplastic disc protein IPR003126 Zinc finger, N-recognin IPR009091 Regulator of chromosome condensation 1/beta-lactamase-inhibitor protein II IPR013993 Zinc finger, N-recognin, metazoa IPR024725 E3 ubiquitin ligase EDD, ubiquitin-associated domain |
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PFAM |
PF00632
PF00658 PF02207 PF11547 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00119
SM00517 SM00396 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O95071 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O95071 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q49A65 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51366 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.737832 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_056986 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16806 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 608413 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34933 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06436 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB020703 AF006010 AK002172 AP002907 AP002981 BC044598 BC137234 U95000 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD01259 AAF88143 AAH44598 AAI37235 BAA74919 BAG51024 | ||||||||||||||||||||||||