Homo sapiens Protein: NDST1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-53743.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NDST1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HSST; NST1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000261797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-53741 (NDST1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Essential bifunctional enzyme that catalyzes both the N- deacetylation and the N-sulfation of glucosamine (GlcNAc) of the glycosaminoglycan in heparan sulfate. Modifies the GlcNAc-GlcA disaccharide repeating sugar backbone to make N-sulfated heparosan, a prerequisite substrate for later modifications in heparin biosynthesis. Plays a role in determining the extent and pattern of sulfation of heparan sulfate. Compared to other NDST enzymes, its presence is absolutely required. Participates in biosynthesis of heparan sulfate that can ultimately serve as L- selectin ligands, thereby playing a role in inflammatory response. {ECO:0000269PubMed:10758005, ECO:0000269PubMed:12634318}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Golgi apparatus membrane {ECO:0000269PubMed:9230113}; Single-pass type II membrane protein {ECO:0000269PubMed:9230113}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. Expression is most abundant in heart, liver and pancreas. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000863
Sulfotransferase domain IPR021930 Heparan sulphate-N-deacetylase IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00685
PF12062 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P52848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P52848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E5RGN9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3340 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.222055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001534 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7680 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC008472 AC011383 BC012888 U17970 U18918 U36600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA67765 AAA75281 AAC27354 AAH12888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||