Mus musculus Protein: Prpf6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-542929.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf6 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PRP6 pre-mRNA splicing factor 6 homolog (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1190003A07Rik; 2610031L17Rik; ANT-1; U5-102K; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000121340 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-214170 (Prpf6) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in pre-mRNA splicing as component of the U4/U6- U5 tri-snRNP complex, one of the building blocks of the spliceosome. Enhances dihydrotestosterone-induced transactivation activity of AR, as well as dexamethasone-induced transactivation activity of NR3C1, but does not affect estrogen-induced transactivation. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. Nucleus speckle {ECO:0000250}. Note=Localized in splicing speckles. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 63 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1922946 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003107
RNA-processing protein, HAT helix IPR010491 PRP1 splicing factor, N-terminal IPR013026 Tetratricopeptide repeat-containing domain IPR019734 Tetratricopeptide repeat |
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PFAM |
PF02184
PF06424 PF13174 PF13176 PF13181 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00386
SM00028 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q91YR7 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q91YR7 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B7ZCS1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 68879 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.418200 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prpf6 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK011639 AK081998 AK145461 AL844529 BC005801 BC014869 BC023691 BC025030 CH466626 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH05801 AAH14869 AAH23691 AAH25030 BAB27751 BAC38390 BAE26451 CAX15563 EDL07438 | ||||||||||||||||||||||