Homo sapiens Protein: ERCC1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-57511.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ERCC1 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1 (includes overlapping antisense sequence) | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | COFS4; RAD10; UV20; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000300853 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-57509 (ERCC1) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Isoform 1: Non-catalytic component of a structure- specific DNA repair endonuclease responsible for the 5'-incision during DNA repair. Responsible, in conjunction with SLX4, for the first step in the repair of interstrand cross-links (ICL). Participates in the processing of anaphase bridge-generating DNA structures, which consist in incompletely processed DNA lesions arising during S or G2 phase, and can result in cytokinesis failure. Also required for homology-directed repair (HDR) of DNA double-strand breaks, in conjunction with SLX4. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 1: Nucleus.Isoform 2: Cytoplasm. Nucleus.Isoform 3: Nucleus.Isoform 4: Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Cerebro-oculo-facio-skeletal syndrome 4 (COFS4) [MIM:610758]: A disorder of prenatal onset characterized by microcephaly, congenital cataracts, facial dysmorphism, neurogenic arthrogryposis, growth failure and severe psychomotor retardation. COFS is considered to be part of the nucleotide-excision repair disorders spectrum that include also xeroderma pigmentosum, trichothiodystrophy and Cockayne syndrome. {ECO:0000269PubMed:17273966, ECO:0000269PubMed:23623389}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000445
Helix-hairpin-helix motif IPR004579 DNA repair protein rad10 IPR010994 RuvA domain 2-like IPR011335 Restriction endonuclease type II-like |
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PFAM |
PF00633
PF03834 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P07992 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P07992 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8WWH8 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 2067 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.672821 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001974 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:3433 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 126380 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12662 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00533 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB069681 AC092309 AC138128 AC138534 AC139353 AF001925 AF433652 AF512555 AK092039 AK314884 BC008930 BC052813 BT019806 CH471126 M13194 M26163 M28650 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35810 AAA52394 AAA52395 AAC16253 AAH08930 AAH52813 AAL56574 AAM34796 AAV38609 BAB62810 BAG37398 BAG52472 EAW57348 EAW57349 EAW57350 | ||||||||||||||||||||||||