Homo sapiens Protein: HNRNPC | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-597528.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HNRNPC | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2) | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C1; C2; HNRNP; HNRPC; SNRPC; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000451291 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-2589 (HNRNPC) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Binds pre-mRNA and nucleates the assembly of 40S hnRNP particles. Single HNRNPC tetramers bind 230-240 nucleotides. Trimers of HNRNPC tetramers bind 700 nucleotides. May play a role in the early steps of spliceosome assembly and pre-mRNA splicing. Interacts with poly-U tracts in the 3'-UTR or 5'-UTR of mRNA and modulates the stability and the level of translation of bound mRNA molecules. {ECO:0000269PubMed:12509468, ECO:0000269PubMed:16010978, ECO:0000269PubMed:7567451, ECO:0000269PubMed:8264621}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Note=Component of ribonucleosomes. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 173 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR016137 Regulator of G protein signalling superfamily IPR017347 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C, Raly |
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PFAM |
PF00076
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF037992
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SMART |
SM00360
SM00315 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P07910 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P07910 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3V575 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3183 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.735530 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_112604 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5035 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 164020 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41915 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01243 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209527 AK223517 AL135744 BC003394 BC007052 BC008364 BC008423 BC066932 BC089438 BC103758 BC108658 BX161480 BX247961 BX247992 CH471078 M16342 M29063 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36576 AAA52680 AAH03394 AAH07052 AAH08364 AAH08423 AAH66932 AAH89438 AAI03759 AAI08659 BAD92764 BAD97237 CAD61934 CAD62300 CAD62326 EAW66392 EAW66393 EAW66394 EAW66395 EAW66396 EAW66399 EAW66400 | ||||||||||||||||||||||||||