Homo sapiens Protein: DHX36 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-62015.7 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DHX36 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000309296 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-62011 (DHX36) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Proposed to have a global role in regulating mRNA expression including transcriptional regulation and mRNA stability. Binds with high affinity to and resolves tetramolecular RNA and DNA quadruplex structures. Unwinds intramolecular quadruplexes derived from the ZIC1 and the MYC promoters. Binds to quadruplex structures in the promoters of YY1 and ALPL genes and regulates their expression. Binds to telomerase RNA template component (TERC) 5'-end (nucleotides 1-43) and unwinds an internal quadruplex formation in TERC 5'-end to promote P1 helix formation; the P1 helix acts as a template boundary ensuring accurate reverse transcription and is disrupted by quadruplex formation. May be involved in regulation of telomere length. Plays a role in degradation and deadenylation of mRNAs containing in their 3'-UTR the consensus ARE sequence element. May function in sex development and spermatogenesis. May play a role in ossification. {ECO:0000269PubMed:12198572, ECO:0000269PubMed:14731398, ECO:0000269PubMed:16150737, ECO:0000269PubMed:18842585, ECO:0000269PubMed:20472641, ECO:0000269PubMed:21149580, ECO:0000269PubMed:21586581, ECO:0000269PubMed:21993297, ECO:0000269PubMed:22238380}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Chromosome, telomere {ECO:0000305}. Note=Isoform 1 preferentially localized to the nucleus and isoform 2 localized to the cytoplasm. However, partitioning of cellular localization between the nucleus and cytoplasm is not exclusive, as isoform 1 was also detected in the cytoplasm. Both isoforms were excluded from nucleoli. Localizes to cytoplasmic stress granules. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in testis. {ECO:0000269PubMed:12198572, ECO:0000269PubMed:14731398}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 37 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR007502 Helicase-associated domain IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR011709 Domain of unknown function DUF1605 IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF04408 PF00270 PF07717 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00847 SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9H2U1 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9H2U1 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 170506 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.599620 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14410 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 612767 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09918 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB040921 AC018452 AC134026 AF217190 AJ577133 AJ577134 AK314435 BC036035 CH471052 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG36783 AAH36035 BAA96012 BAG37047 CAE11802 CAE11803 EAW78761 | ||||||||||||||||||||||||||||