Version 5.4
| Homo sapiens Protein: TRIM47 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-69066.5 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | TRIM47 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | tripartite motif containing 47 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000254816 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-69064 (TRIM47) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | |||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:11511098}. Nucleus {ECO:0000269PubMed:11511098}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Low expression in most tissues. Higher expression in kidney tubular cells. Overexpressed in astrocytoma tumor cells. {ECO:0000269PubMed:11511098}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR001870 B30.2/SPRY domain IPR003877 SPRY domain IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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| PFAM |
PF00643
PF13639 PF14634 PF00622 PF00097 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00336
SM00184 SM00449 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q96LD4 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q96LD4 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | Q96AD0 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 91107 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.293660 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_258411 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:19020 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 611041 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS32737 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 15564 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC087289 AY026763 BC006153 BC009225 BC017299 CH471099 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH06153 AAH09225 AAH17299 AAK07687 EAW89332 | ||||||||||||||||||