Bos taurus Protein: PRPF6 | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-692683.3 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF6 | ||||||||||||||||||||
Protein Name | pre-mRNA-processing factor 6 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSBTAP00000015480 | ||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-640419 (PRPF6) | ||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||
Function | Involved in pre-mRNA splicing as component of the U4/U6- U5 tri-snRNP complex, one of the building blocks of the spliceosome. Enhances dihydrotestosterone-induced transactivation activity of AR, as well as dexamethasone-induced transactivation activity of NR3C1, but does not affect estrogen-induced transactivation. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. Nucleus speckle {ECO:0000250}. Note=Localized in splicing speckles. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 59 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003107
HAT (Half-A-TPR) repeat IPR010491 PRP1 splicing factor, N-terminal IPR013026 Tetratricopeptide repeat-containing domain IPR019734 Tetratricopeptide repeat |
||||||||||||||||||||
PFAM |
PF02184
PF06424 PF13174 PF13176 PF13181 |
||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||
SMART |
SM00386
SM00028 |
||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | Q2KJJ0 | ||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 534228 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.40556 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001039840 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AAFC03042419 BC105318 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAI05319 | ||||||||||||||||||||